اختلاف‌ها بر سر ساختار مدیریت و برنامه ریزی برای هوش مصنوعی که این روزها به مقوله ای مهم و اساسی در جهان تبدیل شده  ، ماه ها  ست بین دولت و مجلس ادامه دارد .
دولت ابتدا برای بررسی و آماده سازی مقدمات کاربرد هوش مصنوعی در حوزه های مختلف، اقدام به تشکیل ستادی زیر نظر معاون اول رئیس‌جمهوری کرد و دبیری آن به معاونت علمی ریاست جمهوری تفویض شد .
دولت معتقد است که فعلا ساختار ستادی برای پیشبرد اهداف حوزه هوش مصنوعی کافی و کارآمد است ولی مجلس   با اتکا به طرح ملی توسعه هوش مصنوعی، بر این باور است که سازمان ملی هوش مصنوعی باید به عنوان یک نهاد مستقل و بالادستی احیا و تثبیت شود تا بتواند نقش راهبری و سیاستگذاری کلان در این حوزه را به شکل جامع ایفا کند .
حسین افشین، معاون علمی رئیس جمهوری در گفتگو با خبرنگار ما  دراین باره اظهار داشت:  در صورت تصویب طرح ملی هوش مصنوعی در مجلس و تشکیل سازمان ملی هوش مصنوعی، ستاد توسعه فناوری و کاربرد هوش مصنوعی همچنان سر جای خود باقی خواهد ماند .
وی در پاسخ به این سئوال که آیا دلیل تصمیم دولت برای تشکیل ستاد هوش مصنوعی به جای سازمان هوش مصنوعی ناشی از تجربیات گذشته از طرح هایی مانند شرکت‌های دانش بنیان و پیام رسان های اجتماعی داخلی است؟ گفت: بله،   در گذشته تجربه ورود به حوزه
 فن آوری را داشته ایم و سعی کردیم از نقاط قوت آنها بهره ببریم و از نقاط ضعف آن طرح ها دوری کنیم. دلیل اینکه به جای سازمان، ستاد هوش مصنوعی تشکیل شد این بود که تشکیل سازمان حجیم و هزینه بر است و پیچیدگی های خاص خودش را دارد و طرح در پیچ و خم امور اداری گرفتار می شود ولی در ستاد کار با سرعت بیشتر و حاشیه کمتر پیش می رود .
افشین گفت: موضوع هوش مصنوعی، حتی در دنیا هم موضوعی جدید و در حال گسترش است، به همین دلیل برای اینکه مقدمات کار در این حوزه فراهم شود  نیازمند تشکیلاتی چابک و تخصصی هستیم که در ساختار سازمان ممکن است به این مهم دست پیدا نکنیم.ما نقشه راه مدرنی تهیه کرده ایم و طبق برنامه قدم به قدم به هدف نهایی نزدیک خواهیم شد. از آموزش برنامه نویسی آغاز کرده ایم و به مرور به لایه های عمیق تر می رسیم و برنامه کاملی داریم. اگر بخواهیم این فعالیت ها را در قالب سازمان هوش مصنوعی پیگیری کنیم، از عمق هدف دور 
می شویم و در سطح گسترش پیدا می کنیم که دستآورد منحصر به فردی برای ما نخواهد داشت.
وی با اشاره به ضعف کشور در زمینه نیروی انسانی متخصص در حوزه هوش مصنوعی، از تلاش برای تقویت این حوزه خبر داد و گفت: در حال شناسایی و حمایت از اساتید و دانشگاه‌های دارای ظرفیت در این زمینه هستیم .به همین علت تلاش می کنیم که ستاد هوش مصنوعی منحل نشود زیرا برنامه ریزی ما در قالب ستاد و از پایه تعریف شده   و به شدت نیاز است که بودجه را مدیریت کنیم تا صرف امور اداری غیر ضروری نشود.
با توجه به اظهارات  معاون علمی و فنآوری رئیس جمهوری و با توجه به اینکه در گذشته تجربه نا موفقی در راه اندازی شبکه های اجتماعی داخلی تجربه کرده ایم و این شبکه ها با وجود صرف هزینه های هنگفت صدها میلیارد تومانی و حمایت تمام قد دولت از آنها  نتوانستند جایگاه مناسبی در بین کاربران پیدا کنند، به نظر می رسد این بار دولت و به ویژه معاونت علمی ریاست جمهوری راه درستی را در پیش گرفته اند و به جای بزرگنمایی کاذب طرح هوش مصنوعی و درگیر شدن با پروسه های اداری دست و پا گیر، قصد دارند با حداقل حواشی و تشریفات اداری، به شکل تخصصی در مسیر استقرار هوش مصنوعی در کشور تمرکز داشته باشند.
مسلماً بعد از گذار از مراحل زیر ساختی و مستقر شدن هوش مصنوعی در ساختار تخصصی کشور، تشکیل سازمان هوش مصنوعی برای گسترش آن در ابعاد جامع تر و عمومی تر، لازم به نظر می رسد ولی   راه اندازی تشکیلات عریض و طویل، نه فقط هیچ کمکی به استقرار صحیح و تخصصی هوش مصنوعی در اداره امور کشور نمی کند بلکه موجب ایجاد حواشی کاذب و حتی انحراف از مسیر درست می شود.